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CRISPR-Cas 기반 CCSAS로 밝힌 굴 유생의 진핵 미생물군집 구성 분석

진핵 미생물군집(eukaryotic microbiome)은 식물과 동물의 건강에 중요한 영향을 미치며, 생물학적·생태학적·진화학적으로도 큰 의미를 가진다. 하지만 대부분의 미생물군집 연구는 16S rRNA를 표지로 하는 세균 중심의 분석에 집중되어 있었고, 진핵 미생물, 특히 단세포 진핵생물에 대한 정보는 제한적이었다. 이는 18S rRNA 유전자를 증폭할 때 숙주 유래 서열이 우세하여 미생물 서열이 묻혀버리기 때문이다. 본 논문에서는 이러한 한계를 극복하고 진핵 미생물군집을 고해상도로 분석할 수 있도록 개발된 새로운 기술인 CRISPR-Cas Selective Amplicon Sequencing(CCSAS)을 소개하고, 이를 굴 유생(oyster spat)에 적용한 결과를 제시한다.연구 배경 및 중요성.. 카테고리 없음 2025. 4. 26.

A tool for CRISPR-Cas9 gRNA evaluation based on computational models of gene expression - 리뷰

본 리뷰에서는 Cohen et al.이 Genome Medicine (2024년)에 발표한 연구, "A tool for CRISPR-Cas9 gRNA evaluation based on computational models of gene expression"을 다룹니다. 본 논문은 CRISPR-Cas9 유전자 편집 기술의 핵심 구성 요소 중 하나인 gRNA(single-guide RNA)의 기능성을 평가하는 새로운 컴퓨팅 도구인 EXPosition을 소개합니다. 기존의 도구들이 DNA 절단 효율 및 단백질 수준의 기능 손실 가능성에 집중한 반면, EXPosition은 유전자 발현(전사, 스플라이싱, 번역 개시)에 미치는 영향을 통합적으로 고려합니다. 저자들은 이 도구가 4개 세포주, 6개 데이터셋, 20.. 카테고리 없음 2025. 4. 25.

CRISPR/CAS9을 이용한 Abi1 제거가 p185Bcr-Abl 유도 백혈병 발생과 ERK 및 PI3K/Akt 신호 전달을 억제함

본 논문은 CRISPR/Cas9 기술을 활용하여 백혈병 발병에 중요한 역할을 하는 p185Bcr-Abl 유전자에 의한 세포 변화에 대해, Abl interactor 1(Abi1)의 기능을 완전히 제거함으로써 어떤 생물학적 변화가 유도되는지를 규명한 연구이다. Abi1은 세포 골격 구조 재편과 수용체 신호전달 조절에 중요한 WAVE 조절 복합체(WRC)의 구성 요소이며, Bcr-Abl 양성 백혈병의 발병에 기여하는 것으로 알려져 있다. 연구진은 마우스 유래 전구 B 세포인 Ba/F3 세포를 이용해 Abi1을 제거하였을 때, 세포 증식, 화학주성, 그리고 in vivo에서의 백혈병 유발 능력이 현저히 감소함을 입증하였다. 본 연구는 Abi1이 p185Bcr-Abl의 신호 전달과 백혈병 발생에 핵심적 역할을 .. 카테고리 없음 2025. 4. 24.

CRISPR-Cas9 knockout screen identifies novel treatment targets in childhood high-grade glioma - 치료 타겟 발굴을 위한 유전자 제거 스크린의 혁신

소아 고등급 신경교종(high-grade glioma, HGG)은 뇌종양 중에서도 특히 예후가 좋지 않은 유형으로, 현재까지 효과적인 치료법이 매우 제한적입니다. 본 논문에서는 CRISPR-Cas9 기반의 전장 유전자 제거 스크린(knockout screen)을 통해 소아 HGG의 암줄기세포(cancer stem cells, CSC)에서 필수적인 새로운 유전자를 발굴하고, 이들이 향후 치료 타겟으로 사용될 가능성을 제시하였습니다. 특히, H3K27M 돌연변이를 보유한 종양 모델을 활용함으로써 실제 환자와 유사한 조건에서 실험이 수행되었고, 이를 통해 UBE2N, CHD4, LSM11, KANSL1, KANSL3, EED와 같은 유전자들이 CSC 생존에 중요하다는 점이 밝혀졌습니다. 이러한 발견은 새로운 .. 카테고리 없음 2025. 4. 23.

Knocking out consumer concerns and regulator’s rules: efficient use of CRISPR/Cas ribonucleoprotein complexes for genome editing in cereals - 논문 리뷰

이 리뷰는 Felix Wolter와 Holger Puchta가 2017년 Genome Biology에 발표한 논문 "Knocking out consumer concerns and regulator’s rules: efficient use of CRISPR/Cas ribonucleoprotein complexes for genome editing in cereals"에 대한 것이다. 본 논문은 CRISPR/Cas9 리보핵단백질(RNP)을 이용한 DNA-free 유전체 편집이 옥수수와 밀에 성공적으로 적용된 사례를 중점적으로 다루며, 특히 소비자와 규제 당국이 제기하는 GMO 관련 우려를 해소할 수 있는 가능성을 제시하고 있다. 기존의 DNA 기반 전달 방식과는 달리, 단백질 형태로 직접 전달된 RNP 복합.. 카테고리 없음 2025. 4. 22.

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